Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP21Q9UK80 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP21Q9UK80 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP21Q9UK80 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP21Q9UK80 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP21Q9UK80 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP21Q9UK80 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP21Q9UK80 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP21Q9UK80 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
USP21Q9UK80 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP21Q9UK80 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP21Q9UK80 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP21Q9UK80 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
USP21Q9UK80 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP21Q9UK80 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP21Q9UK80 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP21Q9UK80 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP21Q9UK80 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP21Q9UK80 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP21Q9UK80 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP21Q9UK80 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP21Q9UK80 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP21Q9UK80 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP21Q9UK80 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP21Q9UK80 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP21Q9UK80 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP21Q9UK80 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP21Q9UK80 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP21Q9UK80 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP21Q9UK80 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP21Q9UK80 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP21Q9UK80 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP21Q9UK80 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP21Q9UK80 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP21Q9UK80 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
USP21Q9UK80 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP21Q9UK80 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP21Q9UK80 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP21Q9UK80 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP21Q9UK80 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP21Q9UK80 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
USP21Q9UK80 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP21Q9UK80 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP21Q9UK80 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP21Q9UK80 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP21Q9UK80 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP21Q9UK80 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP21Q9UK80 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP21Q9UK80 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP21Q9UK80 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP21Q9UK80 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
USP21Q9UK80 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP21Q9UK80 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
USP21Q9UK80 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP21Q9UK80 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP21Q9UK80 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP21Q9UK80 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP21Q9UK80 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP21Q9UK80 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP21Q9UK80 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP21Q9UK80 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
USP21Q9UK80 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
USP21Q9UK80 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
USP21Q9UK80 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
USP21Q9UK80 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
USP21Q9UK80 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
USP21Q9UK80 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
USP21Q9UK80 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP21Q9UK80 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP21Q9UK80 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP21Q9UK80 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP21Q9UK80 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP21Q9UK80 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP21Q9UK80 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP21Q9UK80 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP21Q9UK80 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP21Q9UK80 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP21Q9UK80 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP21Q9UK80 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP21Q9UK80 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP21Q9UK80 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP21Q9UK80 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP21Q9UK80 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP21Q9UK80 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP21Q9UK80 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP21Q9UK80 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP21Q9UK80 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP21Q9UK80 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP21Q9UK80 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP21Q9UK80 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP21Q9UK80 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
USP21Q9UK80 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP21Q9UK80 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP21Q9UK80 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP21Q9UK80 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP21Q9UK80 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP21Q9UK80 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
USP21Q9UK80 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP21Q9UK80 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP21Q9UK80 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms