Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SALL4Q9UJQ4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms