Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ68

MSRA, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRAQ9UJ68 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MSRAQ9UJ68 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms