Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms