Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP25Q9UHP3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP25Q9UHP3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP25Q9UHP3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP25Q9UHP3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP25Q9UHP3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP25Q9UHP3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP25Q9UHP3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP25Q9UHP3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP25Q9UHP3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP25Q9UHP3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP25Q9UHP3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP25Q9UHP3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
USP25Q9UHP3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP25Q9UHP3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP25Q9UHP3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP25Q9UHP3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP25Q9UHP3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP25Q9UHP3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP25Q9UHP3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP25Q9UHP3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP25Q9UHP3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP25Q9UHP3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP25Q9UHP3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP25Q9UHP3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP25Q9UHP3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP25Q9UHP3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP25Q9UHP3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
USP25Q9UHP3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP25Q9UHP3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP25Q9UHP3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP25Q9UHP3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP25Q9UHP3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP25Q9UHP3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP25Q9UHP3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP25Q9UHP3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
USP25Q9UHP3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP25Q9UHP3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP25Q9UHP3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP25Q9UHP3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP25Q9UHP3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP25Q9UHP3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP25Q9UHP3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP25Q9UHP3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP25Q9UHP3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP25Q9UHP3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP25Q9UHP3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP25Q9UHP3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP25Q9UHP3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP25Q9UHP3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP25Q9UHP3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP25Q9UHP3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP25Q9UHP3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP25Q9UHP3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP25Q9UHP3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP25Q9UHP3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP25Q9UHP3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP25Q9UHP3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP25Q9UHP3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
USP25Q9UHP3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms