Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms