Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms