Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms