Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PHRF1Q9P1Y6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PHRF1Q9P1Y6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PHRF1Q9P1Y6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PHRF1Q9P1Y6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PHRF1Q9P1Y6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PHRF1Q9P1Y6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PHRF1Q9P1Y6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PHRF1Q9P1Y6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PHRF1Q9P1Y6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PHRF1Q9P1Y6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PHRF1Q9P1Y6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PHRF1Q9P1Y6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PHRF1Q9P1Y6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PHRF1Q9P1Y6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PHRF1Q9P1Y6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PHRF1Q9P1Y6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PHRF1Q9P1Y6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PHRF1Q9P1Y6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PHRF1Q9P1Y6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PHRF1Q9P1Y6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PHRF1Q9P1Y6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PHRF1Q9P1Y6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PHRF1Q9P1Y6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PHRF1Q9P1Y6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PHRF1Q9P1Y6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PHRF1Q9P1Y6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PHRF1Q9P1Y6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PHRF1Q9P1Y6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PHRF1Q9P1Y6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PHRF1Q9P1Y6 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PHRF1Q9P1Y6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PHRF1Q9P1Y6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PHRF1Q9P1Y6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PHRF1Q9P1Y6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PHRF1Q9P1Y6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PHRF1Q9P1Y6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PHRF1Q9P1Y6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PHRF1Q9P1Y6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PHRF1Q9P1Y6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
PHRF1Q9P1Y6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PHRF1Q9P1Y6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PHRF1Q9P1Y6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PHRF1Q9P1Y6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PHRF1Q9P1Y6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PHRF1Q9P1Y6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PHRF1Q9P1Y6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PHRF1Q9P1Y6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PHRF1Q9P1Y6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PHRF1Q9P1Y6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PHRF1Q9P1Y6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PHRF1Q9P1Y6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PHRF1Q9P1Y6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PHRF1Q9P1Y6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PHRF1Q9P1Y6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PHRF1Q9P1Y6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PHRF1Q9P1Y6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PHRF1Q9P1Y6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PHRF1Q9P1Y6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PHRF1Q9P1Y6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PHRF1Q9P1Y6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PHRF1Q9P1Y6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PHRF1Q9P1Y6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PHRF1Q9P1Y6 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PHRF1Q9P1Y6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PHRF1Q9P1Y6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PHRF1Q9P1Y6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PHRF1Q9P1Y6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PHRF1Q9P1Y6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PHRF1Q9P1Y6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PHRF1Q9P1Y6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PHRF1Q9P1Y6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PHRF1Q9P1Y6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PHRF1Q9P1Y6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PHRF1Q9P1Y6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PHRF1Q9P1Y6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PHRF1Q9P1Y6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PHRF1Q9P1Y6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PHRF1Q9P1Y6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PHRF1Q9P1Y6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PHRF1Q9P1Y6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PHRF1Q9P1Y6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PHRF1Q9P1Y6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PHRF1Q9P1Y6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PHRF1Q9P1Y6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PHRF1Q9P1Y6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PHRF1Q9P1Y6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PHRF1Q9P1Y6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PHRF1Q9P1Y6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PHRF1Q9P1Y6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PHRF1Q9P1Y6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PHRF1Q9P1Y6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PHRF1Q9P1Y6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PHRF1Q9P1Y6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PHRF1Q9P1Y6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PHRF1Q9P1Y6 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PHRF1Q9P1Y6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PHRF1Q9P1Y6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PHRF1Q9P1Y6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PHRF1Q9P1Y6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms