Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U1

ACTR3B, Actin-related protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3BQ9P1U1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTR3BQ9P1U1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTR3BQ9P1U1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTR3BQ9P1U1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTR3BQ9P1U1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTR3BQ9P1U1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTR3BQ9P1U1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTR3BQ9P1U1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTR3BQ9P1U1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTR3BQ9P1U1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTR3BQ9P1U1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTR3BQ9P1U1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTR3BQ9P1U1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTR3BQ9P1U1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTR3BQ9P1U1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTR3BQ9P1U1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTR3BQ9P1U1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTR3BQ9P1U1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTR3BQ9P1U1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms