Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZD8

SPG21, Maspardin, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPG21Q9NZD8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms