Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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