Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms