Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRMT1Q9NXH9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms