Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CWC25Q9NXE8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CWC25Q9NXE8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CWC25Q9NXE8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CWC25Q9NXE8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CWC25Q9NXE8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CWC25Q9NXE8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CWC25Q9NXE8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CWC25Q9NXE8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CWC25Q9NXE8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CWC25Q9NXE8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CWC25Q9NXE8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CWC25Q9NXE8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CWC25Q9NXE8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CWC25Q9NXE8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CWC25Q9NXE8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CWC25Q9NXE8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CWC25Q9NXE8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CWC25Q9NXE8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CWC25Q9NXE8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CWC25Q9NXE8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CWC25Q9NXE8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CWC25Q9NXE8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CWC25Q9NXE8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CWC25Q9NXE8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CWC25Q9NXE8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CWC25Q9NXE8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CWC25Q9NXE8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CWC25Q9NXE8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CWC25Q9NXE8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CWC25Q9NXE8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CWC25Q9NXE8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CWC25Q9NXE8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CWC25Q9NXE8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CWC25Q9NXE8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CWC25Q9NXE8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CWC25Q9NXE8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CWC25Q9NXE8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CWC25Q9NXE8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CWC25Q9NXE8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CWC25Q9NXE8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CWC25Q9NXE8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CWC25Q9NXE8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CWC25Q9NXE8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CWC25Q9NXE8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CWC25Q9NXE8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CWC25Q9NXE8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CWC25Q9NXE8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CWC25Q9NXE8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CWC25Q9NXE8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CWC25Q9NXE8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms