Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX78

TMEM260, Transmembrane protein 260, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260Q9NX78 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM260Q9NX78 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms