Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
IFT57Q9NWB7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
IFT57Q9NWB7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
IFT57Q9NWB7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
IFT57Q9NWB7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
IFT57Q9NWB7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
IFT57Q9NWB7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IFT57Q9NWB7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IFT57Q9NWB7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
IFT57Q9NWB7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
IFT57Q9NWB7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IFT57Q9NWB7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IFT57Q9NWB7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
IFT57Q9NWB7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
IFT57Q9NWB7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
IFT57Q9NWB7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IFT57Q9NWB7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IFT57Q9NWB7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IFT57Q9NWB7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IFT57Q9NWB7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
IFT57Q9NWB7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
IFT57Q9NWB7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IFT57Q9NWB7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
IFT57Q9NWB7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IFT57Q9NWB7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IFT57Q9NWB7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IFT57Q9NWB7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IFT57Q9NWB7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
IFT57Q9NWB7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IFT57Q9NWB7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
IFT57Q9NWB7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
IFT57Q9NWB7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
IFT57Q9NWB7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
IFT57Q9NWB7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IFT57Q9NWB7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IFT57Q9NWB7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
IFT57Q9NWB7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IFT57Q9NWB7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IFT57Q9NWB7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
IFT57Q9NWB7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
IFT57Q9NWB7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IFT57Q9NWB7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IFT57Q9NWB7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
IFT57Q9NWB7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IFT57Q9NWB7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
IFT57Q9NWB7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IFT57Q9NWB7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
IFT57Q9NWB7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IFT57Q9NWB7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IFT57Q9NWB7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IFT57Q9NWB7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IFT57Q9NWB7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IFT57Q9NWB7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IFT57Q9NWB7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IFT57Q9NWB7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IFT57Q9NWB7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IFT57Q9NWB7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IFT57Q9NWB7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IFT57Q9NWB7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IFT57Q9NWB7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IFT57Q9NWB7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IFT57Q9NWB7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IFT57Q9NWB7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFT57Q9NWB7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFT57Q9NWB7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFT57Q9NWB7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFT57Q9NWB7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFT57Q9NWB7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFT57Q9NWB7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFT57Q9NWB7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFT57Q9NWB7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFT57Q9NWB7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFT57Q9NWB7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFT57Q9NWB7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFT57Q9NWB7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFT57Q9NWB7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFT57Q9NWB7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFT57Q9NWB7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFT57Q9NWB7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFT57Q9NWB7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
IFT57Q9NWB7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFT57Q9NWB7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFT57Q9NWB7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFT57Q9NWB7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFT57Q9NWB7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFT57Q9NWB7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFT57Q9NWB7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFT57Q9NWB7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFT57Q9NWB7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFT57Q9NWB7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFT57Q9NWB7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFT57Q9NWB7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFT57Q9NWB7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFT57Q9NWB7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFT57Q9NWB7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFT57Q9NWB7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFT57Q9NWB7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFT57Q9NWB7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFT57Q9NWB7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFT57Q9NWB7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms