Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms