Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms