Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD3

SETD4, SET domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD4Q9NVD3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SETD4Q9NVD3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms