Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV31

IMP3, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP3Q9NV31 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
IMP3Q9NV31 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms