Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GJB4Q9NTQ9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJB4Q9NTQ9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJB4Q9NTQ9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJB4Q9NTQ9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GJB4Q9NTQ9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJB4Q9NTQ9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJB4Q9NTQ9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJB4Q9NTQ9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJB4Q9NTQ9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJB4Q9NTQ9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJB4Q9NTQ9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJB4Q9NTQ9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJB4Q9NTQ9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJB4Q9NTQ9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms