Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI2

ATP8A2, Phospholipid-transporting ATPase IB, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A2Q9NTI2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP8A2Q9NTI2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms