Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
RRP7BPQ9NSQ0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
RRP7BPQ9NSQ0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
RRP7BPQ9NSQ0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
RRP7BPQ9NSQ0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
RRP7BPQ9NSQ0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
RRP7BPQ9NSQ0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
RRP7BPQ9NSQ0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
RRP7BPQ9NSQ0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
RRP7BPQ9NSQ0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
RRP7BPQ9NSQ0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
RRP7BPQ9NSQ0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
RRP7BPQ9NSQ0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
RRP7BPQ9NSQ0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
RRP7BPQ9NSQ0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
RRP7BPQ9NSQ0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
RRP7BPQ9NSQ0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
RRP7BPQ9NSQ0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
RRP7BPQ9NSQ0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
RRP7BPQ9NSQ0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
RRP7BPQ9NSQ0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
RRP7BPQ9NSQ0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
RRP7BPQ9NSQ0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
RRP7BPQ9NSQ0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
RRP7BPQ9NSQ0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
RRP7BPQ9NSQ0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
RRP7BPQ9NSQ0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
RRP7BPQ9NSQ0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
RRP7BPQ9NSQ0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
RRP7BPQ9NSQ0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
RRP7BPQ9NSQ0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
RRP7BPQ9NSQ0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
RRP7BPQ9NSQ0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
RRP7BPQ9NSQ0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
RRP7BPQ9NSQ0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
RRP7BPQ9NSQ0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
RRP7BPQ9NSQ0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
RRP7BPQ9NSQ0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
RRP7BPQ9NSQ0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
RRP7BPQ9NSQ0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
RRP7BPQ9NSQ0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
RRP7BPQ9NSQ0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
RRP7BPQ9NSQ0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
RRP7BPQ9NSQ0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
RRP7BPQ9NSQ0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.19■■■□□ 2.74
RRP7BPQ9NSQ0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
RRP7BPQ9NSQ0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
RRP7BPQ9NSQ0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
RRP7BPQ9NSQ0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
RRP7BPQ9NSQ0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
RRP7BPQ9NSQ0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
RRP7BPQ9NSQ0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
RRP7BPQ9NSQ0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
RRP7BPQ9NSQ0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
RRP7BPQ9NSQ0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
RRP7BPQ9NSQ0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
RRP7BPQ9NSQ0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
RRP7BPQ9NSQ0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
RRP7BPQ9NSQ0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
RRP7BPQ9NSQ0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
RRP7BPQ9NSQ0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
RRP7BPQ9NSQ0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
RRP7BPQ9NSQ0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
RRP7BPQ9NSQ0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
RRP7BPQ9NSQ0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
RRP7BPQ9NSQ0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
RRP7BPQ9NSQ0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
RRP7BPQ9NSQ0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
RRP7BPQ9NSQ0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
RRP7BPQ9NSQ0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
RRP7BPQ9NSQ0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RRP7BPQ9NSQ0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RRP7BPQ9NSQ0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
RRP7BPQ9NSQ0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RRP7BPQ9NSQ0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RRP7BPQ9NSQ0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
RRP7BPQ9NSQ0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
RRP7BPQ9NSQ0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
RRP7BPQ9NSQ0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
RRP7BPQ9NSQ0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
RRP7BPQ9NSQ0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
RRP7BPQ9NSQ0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
RRP7BPQ9NSQ0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
RRP7BPQ9NSQ0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
RRP7BPQ9NSQ0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
RRP7BPQ9NSQ0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
RRP7BPQ9NSQ0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
RRP7BPQ9NSQ0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
RRP7BPQ9NSQ0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
RRP7BPQ9NSQ0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
RRP7BPQ9NSQ0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
RRP7BPQ9NSQ0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
RRP7BPQ9NSQ0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
RRP7BPQ9NSQ0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
RRP7BPQ9NSQ0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
RRP7BPQ9NSQ0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
RRP7BPQ9NSQ0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
RRP7BPQ9NSQ0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms