Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX6

TMEM167B, Protein kish-B, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM167BQ9NRX6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM167BQ9NRX6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM167BQ9NRX6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM167BQ9NRX6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM167BQ9NRX6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM167BQ9NRX6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM167BQ9NRX6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM167BQ9NRX6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM167BQ9NRX6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM167BQ9NRX6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM167BQ9NRX6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM167BQ9NRX6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM167BQ9NRX6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM167BQ9NRX6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM167BQ9NRX6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM167BQ9NRX6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM167BQ9NRX6 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM167BQ9NRX6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM167BQ9NRX6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM167BQ9NRX6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM167BQ9NRX6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM167BQ9NRX6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM167BQ9NRX6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM167BQ9NRX6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM167BQ9NRX6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM167BQ9NRX6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM167BQ9NRX6 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM167BQ9NRX6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM167BQ9NRX6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM167BQ9NRX6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM167BQ9NRX6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM167BQ9NRX6 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM167BQ9NRX6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM167BQ9NRX6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM167BQ9NRX6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM167BQ9NRX6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM167BQ9NRX6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM167BQ9NRX6 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM167BQ9NRX6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM167BQ9NRX6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM167BQ9NRX6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM167BQ9NRX6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM167BQ9NRX6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM167BQ9NRX6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM167BQ9NRX6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM167BQ9NRX6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM167BQ9NRX6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM167BQ9NRX6 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM167BQ9NRX6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM167BQ9NRX6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM167BQ9NRX6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM167BQ9NRX6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM167BQ9NRX6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM167BQ9NRX6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM167BQ9NRX6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM167BQ9NRX6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM167BQ9NRX6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM167BQ9NRX6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM167BQ9NRX6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM167BQ9NRX6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM167BQ9NRX6 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM167BQ9NRX6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM167BQ9NRX6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM167BQ9NRX6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM167BQ9NRX6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM167BQ9NRX6 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM167BQ9NRX6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM167BQ9NRX6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM167BQ9NRX6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM167BQ9NRX6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM167BQ9NRX6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM167BQ9NRX6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM167BQ9NRX6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM167BQ9NRX6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM167BQ9NRX6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM167BQ9NRX6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM167BQ9NRX6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM167BQ9NRX6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM167BQ9NRX6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM167BQ9NRX6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM167BQ9NRX6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM167BQ9NRX6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM167BQ9NRX6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM167BQ9NRX6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM167BQ9NRX6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM167BQ9NRX6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM167BQ9NRX6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM167BQ9NRX6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM167BQ9NRX6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM167BQ9NRX6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM167BQ9NRX6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM167BQ9NRX6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM167BQ9NRX6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM167BQ9NRX6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM167BQ9NRX6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM167BQ9NRX6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM167BQ9NRX6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM167BQ9NRX6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM167BQ9NRX6 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM167BQ9NRX6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms