Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TULP4Q9NRJ4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TULP4Q9NRJ4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TULP4Q9NRJ4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
TULP4Q9NRJ4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TULP4Q9NRJ4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TULP4Q9NRJ4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TULP4Q9NRJ4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TULP4Q9NRJ4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TULP4Q9NRJ4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TULP4Q9NRJ4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TULP4Q9NRJ4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TULP4Q9NRJ4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TULP4Q9NRJ4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
TULP4Q9NRJ4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
TULP4Q9NRJ4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
TULP4Q9NRJ4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TULP4Q9NRJ4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TULP4Q9NRJ4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TULP4Q9NRJ4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TULP4Q9NRJ4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TULP4Q9NRJ4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TULP4Q9NRJ4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TULP4Q9NRJ4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TULP4Q9NRJ4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TULP4Q9NRJ4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TULP4Q9NRJ4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TULP4Q9NRJ4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TULP4Q9NRJ4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TULP4Q9NRJ4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TULP4Q9NRJ4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TULP4Q9NRJ4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TULP4Q9NRJ4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TULP4Q9NRJ4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TULP4Q9NRJ4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TULP4Q9NRJ4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
TULP4Q9NRJ4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TULP4Q9NRJ4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TULP4Q9NRJ4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TULP4Q9NRJ4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TULP4Q9NRJ4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TULP4Q9NRJ4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TULP4Q9NRJ4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TULP4Q9NRJ4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TULP4Q9NRJ4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TULP4Q9NRJ4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TULP4Q9NRJ4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TULP4Q9NRJ4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TULP4Q9NRJ4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
TULP4Q9NRJ4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TULP4Q9NRJ4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
TULP4Q9NRJ4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
TULP4Q9NRJ4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TULP4Q9NRJ4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TULP4Q9NRJ4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TULP4Q9NRJ4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TULP4Q9NRJ4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TULP4Q9NRJ4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TULP4Q9NRJ4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TULP4Q9NRJ4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TULP4Q9NRJ4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TULP4Q9NRJ4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TULP4Q9NRJ4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TULP4Q9NRJ4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TULP4Q9NRJ4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TULP4Q9NRJ4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TULP4Q9NRJ4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TULP4Q9NRJ4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TULP4Q9NRJ4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TULP4Q9NRJ4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
TULP4Q9NRJ4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TULP4Q9NRJ4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TULP4Q9NRJ4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TULP4Q9NRJ4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TULP4Q9NRJ4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TULP4Q9NRJ4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TULP4Q9NRJ4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TULP4Q9NRJ4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
TULP4Q9NRJ4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
TULP4Q9NRJ4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
TULP4Q9NRJ4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
TULP4Q9NRJ4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TULP4Q9NRJ4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TULP4Q9NRJ4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TULP4Q9NRJ4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TULP4Q9NRJ4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TULP4Q9NRJ4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TULP4Q9NRJ4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TULP4Q9NRJ4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TULP4Q9NRJ4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TULP4Q9NRJ4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TULP4Q9NRJ4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TULP4Q9NRJ4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TULP4Q9NRJ4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TULP4Q9NRJ4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TULP4Q9NRJ4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TULP4Q9NRJ4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TULP4Q9NRJ4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TULP4Q9NRJ4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TULP4Q9NRJ4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms