Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SH2B1Q9NRF2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SH2B1Q9NRF2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SH2B1Q9NRF2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SH2B1Q9NRF2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SH2B1Q9NRF2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SH2B1Q9NRF2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SH2B1Q9NRF2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SH2B1Q9NRF2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SH2B1Q9NRF2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SH2B1Q9NRF2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SH2B1Q9NRF2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SH2B1Q9NRF2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SH2B1Q9NRF2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SH2B1Q9NRF2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SH2B1Q9NRF2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SH2B1Q9NRF2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SH2B1Q9NRF2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SH2B1Q9NRF2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SH2B1Q9NRF2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SH2B1Q9NRF2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SH2B1Q9NRF2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SH2B1Q9NRF2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SH2B1Q9NRF2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SH2B1Q9NRF2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SH2B1Q9NRF2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SH2B1Q9NRF2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SH2B1Q9NRF2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SH2B1Q9NRF2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SH2B1Q9NRF2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SH2B1Q9NRF2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SH2B1Q9NRF2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH2B1Q9NRF2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH2B1Q9NRF2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH2B1Q9NRF2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SH2B1Q9NRF2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH2B1Q9NRF2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH2B1Q9NRF2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH2B1Q9NRF2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH2B1Q9NRF2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH2B1Q9NRF2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH2B1Q9NRF2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH2B1Q9NRF2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH2B1Q9NRF2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH2B1Q9NRF2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH2B1Q9NRF2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH2B1Q9NRF2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH2B1Q9NRF2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH2B1Q9NRF2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH2B1Q9NRF2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms