Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms