Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLCO1B3Q9NPD5 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms