Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCX4

TRPC7, Short transient receptor potential channel 7, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC7Q9HCX4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRPC7Q9HCX4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRPC7Q9HCX4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRPC7Q9HCX4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRPC7Q9HCX4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRPC7Q9HCX4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRPC7Q9HCX4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRPC7Q9HCX4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRPC7Q9HCX4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRPC7Q9HCX4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRPC7Q9HCX4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRPC7Q9HCX4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRPC7Q9HCX4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRPC7Q9HCX4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRPC7Q9HCX4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRPC7Q9HCX4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRPC7Q9HCX4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRPC7Q9HCX4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRPC7Q9HCX4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRPC7Q9HCX4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRPC7Q9HCX4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRPC7Q9HCX4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRPC7Q9HCX4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRPC7Q9HCX4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRPC7Q9HCX4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRPC7Q9HCX4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRPC7Q9HCX4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRPC7Q9HCX4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRPC7Q9HCX4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRPC7Q9HCX4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRPC7Q9HCX4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRPC7Q9HCX4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRPC7Q9HCX4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRPC7Q9HCX4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRPC7Q9HCX4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRPC7Q9HCX4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRPC7Q9HCX4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRPC7Q9HCX4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRPC7Q9HCX4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRPC7Q9HCX4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRPC7Q9HCX4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRPC7Q9HCX4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRPC7Q9HCX4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRPC7Q9HCX4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRPC7Q9HCX4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRPC7Q9HCX4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRPC7Q9HCX4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRPC7Q9HCX4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPC7Q9HCX4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPC7Q9HCX4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPC7Q9HCX4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPC7Q9HCX4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPC7Q9HCX4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPC7Q9HCX4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPC7Q9HCX4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPC7Q9HCX4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPC7Q9HCX4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPC7Q9HCX4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPC7Q9HCX4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPC7Q9HCX4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPC7Q9HCX4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPC7Q9HCX4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPC7Q9HCX4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPC7Q9HCX4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPC7Q9HCX4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPC7Q9HCX4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPC7Q9HCX4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPC7Q9HCX4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPC7Q9HCX4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPC7Q9HCX4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPC7Q9HCX4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPC7Q9HCX4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPC7Q9HCX4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPC7Q9HCX4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPC7Q9HCX4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPC7Q9HCX4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPC7Q9HCX4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPC7Q9HCX4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPC7Q9HCX4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPC7Q9HCX4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPC7Q9HCX4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPC7Q9HCX4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPC7Q9HCX4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPC7Q9HCX4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPC7Q9HCX4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPC7Q9HCX4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPC7Q9HCX4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPC7Q9HCX4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPC7Q9HCX4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPC7Q9HCX4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPC7Q9HCX4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPC7Q9HCX4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPC7Q9HCX4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPC7Q9HCX4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPC7Q9HCX4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPC7Q9HCX4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPC7Q9HCX4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPC7Q9HCX4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRPC7Q9HCX4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRPC7Q9HCX4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms