Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ0

TNRC6C, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6CQ9HCJ0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNRC6CQ9HCJ0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TNRC6CQ9HCJ0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TNRC6CQ9HCJ0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TNRC6CQ9HCJ0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TNRC6CQ9HCJ0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
TNRC6CQ9HCJ0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TNRC6CQ9HCJ0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNRC6CQ9HCJ0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNRC6CQ9HCJ0 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TNRC6CQ9HCJ0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNRC6CQ9HCJ0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNRC6CQ9HCJ0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNRC6CQ9HCJ0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNRC6CQ9HCJ0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNRC6CQ9HCJ0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNRC6CQ9HCJ0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNRC6CQ9HCJ0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNRC6CQ9HCJ0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNRC6CQ9HCJ0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TNRC6CQ9HCJ0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TNRC6CQ9HCJ0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNRC6CQ9HCJ0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNRC6CQ9HCJ0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TNRC6CQ9HCJ0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNRC6CQ9HCJ0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNRC6CQ9HCJ0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNRC6CQ9HCJ0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNRC6CQ9HCJ0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNRC6CQ9HCJ0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNRC6CQ9HCJ0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNRC6CQ9HCJ0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNRC6CQ9HCJ0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNRC6CQ9HCJ0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNRC6CQ9HCJ0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNRC6CQ9HCJ0 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNRC6CQ9HCJ0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNRC6CQ9HCJ0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNRC6CQ9HCJ0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNRC6CQ9HCJ0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNRC6CQ9HCJ0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNRC6CQ9HCJ0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNRC6CQ9HCJ0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TNRC6CQ9HCJ0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNRC6CQ9HCJ0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNRC6CQ9HCJ0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNRC6CQ9HCJ0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNRC6CQ9HCJ0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNRC6CQ9HCJ0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNRC6CQ9HCJ0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNRC6CQ9HCJ0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNRC6CQ9HCJ0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNRC6CQ9HCJ0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNRC6CQ9HCJ0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNRC6CQ9HCJ0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNRC6CQ9HCJ0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNRC6CQ9HCJ0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNRC6CQ9HCJ0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNRC6CQ9HCJ0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNRC6CQ9HCJ0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNRC6CQ9HCJ0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNRC6CQ9HCJ0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNRC6CQ9HCJ0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNRC6CQ9HCJ0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNRC6CQ9HCJ0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNRC6CQ9HCJ0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNRC6CQ9HCJ0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNRC6CQ9HCJ0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TNRC6CQ9HCJ0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TNRC6CQ9HCJ0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNRC6CQ9HCJ0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNRC6CQ9HCJ0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNRC6CQ9HCJ0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNRC6CQ9HCJ0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNRC6CQ9HCJ0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNRC6CQ9HCJ0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNRC6CQ9HCJ0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNRC6CQ9HCJ0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNRC6CQ9HCJ0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNRC6CQ9HCJ0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNRC6CQ9HCJ0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNRC6CQ9HCJ0 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNRC6CQ9HCJ0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNRC6CQ9HCJ0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNRC6CQ9HCJ0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNRC6CQ9HCJ0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNRC6CQ9HCJ0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNRC6CQ9HCJ0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNRC6CQ9HCJ0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNRC6CQ9HCJ0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNRC6CQ9HCJ0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNRC6CQ9HCJ0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNRC6CQ9HCJ0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNRC6CQ9HCJ0 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNRC6CQ9HCJ0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNRC6CQ9HCJ0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNRC6CQ9HCJ0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms