Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC52

CBX8, Chromobox protein homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8Q9HC52 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CBX8Q9HC52 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CBX8Q9HC52 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CBX8Q9HC52 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CBX8Q9HC52 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CBX8Q9HC52 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms