Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9D4

ZNF408, Zinc finger protein 408, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF408Q9H9D4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF408Q9H9D4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF408Q9H9D4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF408Q9H9D4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF408Q9H9D4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF408Q9H9D4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF408Q9H9D4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF408Q9H9D4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF408Q9H9D4 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF408Q9H9D4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF408Q9H9D4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF408Q9H9D4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF408Q9H9D4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF408Q9H9D4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF408Q9H9D4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF408Q9H9D4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF408Q9H9D4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms