Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7F0

ATP13A3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A3Q9H7F0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP13A3Q9H7F0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP13A3Q9H7F0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP13A3Q9H7F0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATP13A3Q9H7F0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATP13A3Q9H7F0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATP13A3Q9H7F0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP13A3Q9H7F0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms