Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E9

C8orf33, UPF0488 protein C8orf33, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf33Q9H7E9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
C8orf33Q9H7E9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
C8orf33Q9H7E9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
C8orf33Q9H7E9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
C8orf33Q9H7E9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C8orf33Q9H7E9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C8orf33Q9H7E9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C8orf33Q9H7E9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C8orf33Q9H7E9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C8orf33Q9H7E9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C8orf33Q9H7E9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C8orf33Q9H7E9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C8orf33Q9H7E9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C8orf33Q9H7E9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
C8orf33Q9H7E9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C8orf33Q9H7E9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C8orf33Q9H7E9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C8orf33Q9H7E9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C8orf33Q9H7E9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C8orf33Q9H7E9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C8orf33Q9H7E9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C8orf33Q9H7E9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms