Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6E4

CCDC134, Coiled-coil domain-containing protein 134, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC134Q9H6E4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC134Q9H6E4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC134Q9H6E4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC134Q9H6E4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC134Q9H6E4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC134Q9H6E4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC134Q9H6E4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC134Q9H6E4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC134Q9H6E4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC134Q9H6E4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC134Q9H6E4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC134Q9H6E4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC134Q9H6E4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC134Q9H6E4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC134Q9H6E4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC134Q9H6E4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC134Q9H6E4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC134Q9H6E4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC134Q9H6E4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC134Q9H6E4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC134Q9H6E4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC134Q9H6E4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC134Q9H6E4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC134Q9H6E4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC134Q9H6E4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC134Q9H6E4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC134Q9H6E4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC134Q9H6E4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC134Q9H6E4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC134Q9H6E4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC134Q9H6E4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC134Q9H6E4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC134Q9H6E4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC134Q9H6E4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC134Q9H6E4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC134Q9H6E4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC134Q9H6E4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC134Q9H6E4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC134Q9H6E4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC134Q9H6E4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC134Q9H6E4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC134Q9H6E4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC134Q9H6E4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC134Q9H6E4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC134Q9H6E4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms