Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5J8

TAF1D, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1DQ9H5J8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TAF1DQ9H5J8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms