Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S6

TNMD, Tenomodulin, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNMDQ9H2S6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNMDQ9H2S6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNMDQ9H2S6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNMDQ9H2S6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNMDQ9H2S6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TNMDQ9H2S6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNMDQ9H2S6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNMDQ9H2S6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TNMDQ9H2S6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNMDQ9H2S6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNMDQ9H2S6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNMDQ9H2S6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNMDQ9H2S6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNMDQ9H2S6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNMDQ9H2S6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNMDQ9H2S6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNMDQ9H2S6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNMDQ9H2S6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNMDQ9H2S6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNMDQ9H2S6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNMDQ9H2S6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TNMDQ9H2S6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNMDQ9H2S6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNMDQ9H2S6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNMDQ9H2S6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNMDQ9H2S6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNMDQ9H2S6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TNMDQ9H2S6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNMDQ9H2S6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNMDQ9H2S6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNMDQ9H2S6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNMDQ9H2S6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNMDQ9H2S6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNMDQ9H2S6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNMDQ9H2S6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNMDQ9H2S6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNMDQ9H2S6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNMDQ9H2S6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNMDQ9H2S6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNMDQ9H2S6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TNMDQ9H2S6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNMDQ9H2S6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNMDQ9H2S6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNMDQ9H2S6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNMDQ9H2S6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TNMDQ9H2S6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNMDQ9H2S6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNMDQ9H2S6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNMDQ9H2S6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNMDQ9H2S6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNMDQ9H2S6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNMDQ9H2S6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNMDQ9H2S6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNMDQ9H2S6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms