Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2E6

SEMA6A, Semaphorin-6A, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6AQ9H2E6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA6AQ9H2E6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms