Protein–RNA interactions for Protein: Q9H204

MED28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28Q9H204 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MED28Q9H204 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms