Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
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