Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0D2

ZNF541, Zinc finger protein 541, humanhuman

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF541Q9H0D2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZNF541Q9H0D2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZNF541Q9H0D2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZNF541Q9H0D2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZNF541Q9H0D2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF541Q9H0D2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF541Q9H0D2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF541Q9H0D2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF541Q9H0D2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF541Q9H0D2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF541Q9H0D2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF541Q9H0D2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF541Q9H0D2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF541Q9H0D2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF541Q9H0D2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF541Q9H0D2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF541Q9H0D2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF541Q9H0D2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF541Q9H0D2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF541Q9H0D2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF541Q9H0D2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF541Q9H0D2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF541Q9H0D2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF541Q9H0D2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF541Q9H0D2 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF541Q9H0D2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF541Q9H0D2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF541Q9H0D2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF541Q9H0D2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF541Q9H0D2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF541Q9H0D2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF541Q9H0D2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF541Q9H0D2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF541Q9H0D2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF541Q9H0D2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF541Q9H0D2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF541Q9H0D2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF541Q9H0D2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF541Q9H0D2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF541Q9H0D2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF541Q9H0D2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF541Q9H0D2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF541Q9H0D2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF541Q9H0D2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF541Q9H0D2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF541Q9H0D2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF541Q9H0D2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF541Q9H0D2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF541Q9H0D2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF541Q9H0D2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF541Q9H0D2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF541Q9H0D2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF541Q9H0D2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF541Q9H0D2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF541Q9H0D2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF541Q9H0D2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF541Q9H0D2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF541Q9H0D2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF541Q9H0D2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF541Q9H0D2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF541Q9H0D2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF541Q9H0D2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF541Q9H0D2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF541Q9H0D2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF541Q9H0D2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF541Q9H0D2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF541Q9H0D2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms