Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZC3H12CQ9C0D7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZC3H12CQ9C0D7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZC3H12CQ9C0D7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZC3H12CQ9C0D7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZC3H12CQ9C0D7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZC3H12CQ9C0D7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ZC3H12CQ9C0D7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZC3H12CQ9C0D7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZC3H12CQ9C0D7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZC3H12CQ9C0D7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZC3H12CQ9C0D7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZC3H12CQ9C0D7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZC3H12CQ9C0D7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZC3H12CQ9C0D7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZC3H12CQ9C0D7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZC3H12CQ9C0D7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZC3H12CQ9C0D7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZC3H12CQ9C0D7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZC3H12CQ9C0D7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZC3H12CQ9C0D7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZC3H12CQ9C0D7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZC3H12CQ9C0D7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZC3H12CQ9C0D7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZC3H12CQ9C0D7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZC3H12CQ9C0D7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZC3H12CQ9C0D7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZC3H12CQ9C0D7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZC3H12CQ9C0D7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZC3H12CQ9C0D7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZC3H12CQ9C0D7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZC3H12CQ9C0D7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZC3H12CQ9C0D7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZC3H12CQ9C0D7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZC3H12CQ9C0D7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZC3H12CQ9C0D7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZC3H12CQ9C0D7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZC3H12CQ9C0D7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZC3H12CQ9C0D7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZC3H12CQ9C0D7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZC3H12CQ9C0D7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZC3H12CQ9C0D7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZC3H12CQ9C0D7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZC3H12CQ9C0D7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZC3H12CQ9C0D7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZC3H12CQ9C0D7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ZC3H12CQ9C0D7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZC3H12CQ9C0D7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ZC3H12CQ9C0D7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZC3H12CQ9C0D7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZC3H12CQ9C0D7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZC3H12CQ9C0D7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZC3H12CQ9C0D7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZC3H12CQ9C0D7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ZC3H12CQ9C0D7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZC3H12CQ9C0D7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZC3H12CQ9C0D7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZC3H12CQ9C0D7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ZC3H12CQ9C0D7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZC3H12CQ9C0D7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZC3H12CQ9C0D7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZC3H12CQ9C0D7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZC3H12CQ9C0D7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZC3H12CQ9C0D7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZC3H12CQ9C0D7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZC3H12CQ9C0D7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZC3H12CQ9C0D7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZC3H12CQ9C0D7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZC3H12CQ9C0D7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZC3H12CQ9C0D7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZC3H12CQ9C0D7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZC3H12CQ9C0D7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZC3H12CQ9C0D7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZC3H12CQ9C0D7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZC3H12CQ9C0D7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZC3H12CQ9C0D7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZC3H12CQ9C0D7 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZC3H12CQ9C0D7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZC3H12CQ9C0D7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZC3H12CQ9C0D7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZC3H12CQ9C0D7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ZC3H12CQ9C0D7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZC3H12CQ9C0D7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZC3H12CQ9C0D7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZC3H12CQ9C0D7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZC3H12CQ9C0D7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ZC3H12CQ9C0D7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZC3H12CQ9C0D7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZC3H12CQ9C0D7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZC3H12CQ9C0D7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZC3H12CQ9C0D7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZC3H12CQ9C0D7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZC3H12CQ9C0D7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZC3H12CQ9C0D7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZC3H12CQ9C0D7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZC3H12CQ9C0D7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms