Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B2

CFAP74, Cilia- and flagella-associated protein 74, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP74Q9C0B2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CFAP74Q9C0B2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CFAP74Q9C0B2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CFAP74Q9C0B2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CFAP74Q9C0B2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CFAP74Q9C0B2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CFAP74Q9C0B2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CFAP74Q9C0B2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CFAP74Q9C0B2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CFAP74Q9C0B2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CFAP74Q9C0B2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CFAP74Q9C0B2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CFAP74Q9C0B2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CFAP74Q9C0B2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CFAP74Q9C0B2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CFAP74Q9C0B2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CFAP74Q9C0B2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CFAP74Q9C0B2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CFAP74Q9C0B2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
CFAP74Q9C0B2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CFAP74Q9C0B2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CFAP74Q9C0B2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CFAP74Q9C0B2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CFAP74Q9C0B2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CFAP74Q9C0B2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
CFAP74Q9C0B2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC32.7■■■□□ 2.82
CFAP74Q9C0B2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
CFAP74Q9C0B2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
CFAP74Q9C0B2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CFAP74Q9C0B2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CFAP74Q9C0B2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CFAP74Q9C0B2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CFAP74Q9C0B2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CFAP74Q9C0B2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CFAP74Q9C0B2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CFAP74Q9C0B2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CFAP74Q9C0B2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CFAP74Q9C0B2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CFAP74Q9C0B2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CFAP74Q9C0B2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CFAP74Q9C0B2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CFAP74Q9C0B2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CFAP74Q9C0B2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CFAP74Q9C0B2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CFAP74Q9C0B2 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
CFAP74Q9C0B2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CFAP74Q9C0B2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CFAP74Q9C0B2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CFAP74Q9C0B2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CFAP74Q9C0B2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CFAP74Q9C0B2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CFAP74Q9C0B2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CFAP74Q9C0B2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CFAP74Q9C0B2 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CFAP74Q9C0B2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
CFAP74Q9C0B2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CFAP74Q9C0B2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CFAP74Q9C0B2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CFAP74Q9C0B2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CFAP74Q9C0B2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CFAP74Q9C0B2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CFAP74Q9C0B2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CFAP74Q9C0B2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CFAP74Q9C0B2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CFAP74Q9C0B2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CFAP74Q9C0B2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CFAP74Q9C0B2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CFAP74Q9C0B2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CFAP74Q9C0B2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CFAP74Q9C0B2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CFAP74Q9C0B2 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CFAP74Q9C0B2 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CFAP74Q9C0B2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CFAP74Q9C0B2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
CFAP74Q9C0B2 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CFAP74Q9C0B2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CFAP74Q9C0B2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CFAP74Q9C0B2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CFAP74Q9C0B2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CFAP74Q9C0B2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CFAP74Q9C0B2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CFAP74Q9C0B2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CFAP74Q9C0B2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CFAP74Q9C0B2 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
CFAP74Q9C0B2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CFAP74Q9C0B2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CFAP74Q9C0B2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CFAP74Q9C0B2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CFAP74Q9C0B2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CFAP74Q9C0B2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CFAP74Q9C0B2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CFAP74Q9C0B2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
CFAP74Q9C0B2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CFAP74Q9C0B2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CFAP74Q9C0B2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CFAP74Q9C0B2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CFAP74Q9C0B2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CFAP74Q9C0B2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CFAP74Q9C0B2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
CFAP74Q9C0B2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms