Protein–RNA interactions for Protein: Q9C029

TRIM7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM7Q9C029 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM7Q9C029 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms