Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms