Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EDEM3Q9BZQ6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EDEM3Q9BZQ6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EDEM3Q9BZQ6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EDEM3Q9BZQ6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EDEM3Q9BZQ6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EDEM3Q9BZQ6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
EDEM3Q9BZQ6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EDEM3Q9BZQ6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EDEM3Q9BZQ6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EDEM3Q9BZQ6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EDEM3Q9BZQ6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EDEM3Q9BZQ6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EDEM3Q9BZQ6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EDEM3Q9BZQ6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EDEM3Q9BZQ6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EDEM3Q9BZQ6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EDEM3Q9BZQ6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EDEM3Q9BZQ6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EDEM3Q9BZQ6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EDEM3Q9BZQ6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EDEM3Q9BZQ6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EDEM3Q9BZQ6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EDEM3Q9BZQ6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EDEM3Q9BZQ6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
EDEM3Q9BZQ6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EDEM3Q9BZQ6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EDEM3Q9BZQ6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EDEM3Q9BZQ6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EDEM3Q9BZQ6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EDEM3Q9BZQ6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EDEM3Q9BZQ6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDEM3Q9BZQ6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDEM3Q9BZQ6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDEM3Q9BZQ6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDEM3Q9BZQ6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDEM3Q9BZQ6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDEM3Q9BZQ6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDEM3Q9BZQ6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms