Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRNKL1Q9BZJ0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRNKL1Q9BZJ0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRNKL1Q9BZJ0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CRNKL1Q9BZJ0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRNKL1Q9BZJ0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRNKL1Q9BZJ0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRNKL1Q9BZJ0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRNKL1Q9BZJ0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRNKL1Q9BZJ0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRNKL1Q9BZJ0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRNKL1Q9BZJ0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRNKL1Q9BZJ0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRNKL1Q9BZJ0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRNKL1Q9BZJ0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRNKL1Q9BZJ0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRNKL1Q9BZJ0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRNKL1Q9BZJ0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRNKL1Q9BZJ0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRNKL1Q9BZJ0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CRNKL1Q9BZJ0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRNKL1Q9BZJ0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRNKL1Q9BZJ0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRNKL1Q9BZJ0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRNKL1Q9BZJ0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRNKL1Q9BZJ0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRNKL1Q9BZJ0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRNKL1Q9BZJ0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CRNKL1Q9BZJ0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CRNKL1Q9BZJ0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRNKL1Q9BZJ0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRNKL1Q9BZJ0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRNKL1Q9BZJ0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRNKL1Q9BZJ0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CRNKL1Q9BZJ0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
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