Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PUS3Q9BZE2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PUS3Q9BZE2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PUS3Q9BZE2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PUS3Q9BZE2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PUS3Q9BZE2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PUS3Q9BZE2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PUS3Q9BZE2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PUS3Q9BZE2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PUS3Q9BZE2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PUS3Q9BZE2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PUS3Q9BZE2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PUS3Q9BZE2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PUS3Q9BZE2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PUS3Q9BZE2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PUS3Q9BZE2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PUS3Q9BZE2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PUS3Q9BZE2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PUS3Q9BZE2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PUS3Q9BZE2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PUS3Q9BZE2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PUS3Q9BZE2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PUS3Q9BZE2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PUS3Q9BZE2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PUS3Q9BZE2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PUS3Q9BZE2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PUS3Q9BZE2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PUS3Q9BZE2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PUS3Q9BZE2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PUS3Q9BZE2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PUS3Q9BZE2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PUS3Q9BZE2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PUS3Q9BZE2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PUS3Q9BZE2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PUS3Q9BZE2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PUS3Q9BZE2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PUS3Q9BZE2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PUS3Q9BZE2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PUS3Q9BZE2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PUS3Q9BZE2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PUS3Q9BZE2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PUS3Q9BZE2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PUS3Q9BZE2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PUS3Q9BZE2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PUS3Q9BZE2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PUS3Q9BZE2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PUS3Q9BZE2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PUS3Q9BZE2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PUS3Q9BZE2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PUS3Q9BZE2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PUS3Q9BZE2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PUS3Q9BZE2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PUS3Q9BZE2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PUS3Q9BZE2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PUS3Q9BZE2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PUS3Q9BZE2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PUS3Q9BZE2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PUS3Q9BZE2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PUS3Q9BZE2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PUS3Q9BZE2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PUS3Q9BZE2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PUS3Q9BZE2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PUS3Q9BZE2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PUS3Q9BZE2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PUS3Q9BZE2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PUS3Q9BZE2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PUS3Q9BZE2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PUS3Q9BZE2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PUS3Q9BZE2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PUS3Q9BZE2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PUS3Q9BZE2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PUS3Q9BZE2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PUS3Q9BZE2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PUS3Q9BZE2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PUS3Q9BZE2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PUS3Q9BZE2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PUS3Q9BZE2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PUS3Q9BZE2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PUS3Q9BZE2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PUS3Q9BZE2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PUS3Q9BZE2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PUS3Q9BZE2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PUS3Q9BZE2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PUS3Q9BZE2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PUS3Q9BZE2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PUS3Q9BZE2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PUS3Q9BZE2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PUS3Q9BZE2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PUS3Q9BZE2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PUS3Q9BZE2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PUS3Q9BZE2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PUS3Q9BZE2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PUS3Q9BZE2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PUS3Q9BZE2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PUS3Q9BZE2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PUS3Q9BZE2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PUS3Q9BZE2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PUS3Q9BZE2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PUS3Q9BZE2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PUS3Q9BZE2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms