Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GABARAPL3Q9BY60 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GABARAPL3Q9BY60 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 210.4 ms